Фамилия Котанчян — яркий пример армянской модели фамилии, где суффикс -ян (в старой орфографии -янц) указывает на принадлежность к роду. Дословно это означает «из рода Котанча» или «потомок Котанча». Основа фамилии, скорее всего, восходит к прозвищу или личному имени Котанч, которое, в свою очередь, могло образоваться от армянского слова «кот» (կոթ) — «рукоятка», «черенок», или от «котан» (կոթան) — «ручка», «держак» (например, у плуга). В таком случае прозвище Котанч могли дать человеку, делавшему рукоятки для инструментов, либо человеку с характерной осанкой или хваткой, которую сравнивали с рукояткой.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с тюркским словом «котан» — «загон для скота», «стойло». Армянские фамилии нередко вбирали в себя лексику соседних народов, особенно в регионах смешанного проживания. Если принять эту версию, то прозвище Котанч могло относиться к пастуху или владельцу скота. Однако первый вариант с армянским корнем выглядит более органичным для словообразовательной модели: суффикс -ч в армянском языке часто образует названия профессий или деятелей (ср. «дпир» — писарь, «дпирач» — писарчук), и Котанч — это «тот, кто работает с котаном».

Географически фамилия Котанчян распространена в Армении и среди армянской диаспоры, но не является частой. В исторических записях, например, в метрических книгах или переписях Закавказья XIX века, она могла фиксироваться в разных вариантах написания, вплоть до Котанджян, что связано с особенностями произношения в разных диалектах. В целом, фамилия Котанчян — типичная для восточноармянской традиции фамилия-профессия, указывающая на ремесленное занятие предка.