Фамилия Кояниди — редкий для России пример греческой фамильной модели на -иди. Суффикс -иди (в русской передаче часто -иди или -ди) характерен для фамилий, образованных в Малой Азии и Понте: он восходит к древнегреческому патронимическому суффиксу -ίδης, означавшему «сын такого-то». Поэтому Кояниди буквально значит «сын Кояна» или «потомок Кояна».

Основа фамилии — личное имя или прозвище Коян. В греческой среде Коян (Κογιάν) могло быть вариантом имени Козма (Косма) или уменьшительной формой от Константин. Но есть и другая, более вероятная версия: в понтийском диалекте греческого языка слово «коян» (κογιάν) означало «заяц». Прозвище Заяц давали быстрому, ловкому или пугливому человеку. Так что Кояниди — это «сын Зайца», то есть человек из рода того, кого прозвали Зайцем.

Носители фамилии Кояниди — это, скорее всего, потомки греков-понтийцев, переселившихся на территорию Российской империи в XIX — начале XX века из Трапезунда, Самсуна или других областей Причерноморья. Основные волны миграции пришлись на 1828–1829 годы (после русско-турецкой войны) и на 1914–1923 годы (геноцид понтийских греков). Поэтому географически Кояниди чаще всего встречаются в Краснодарском крае, Ростовской области, Ставрополье и в Абхазии — там, где сложились компактные греческие общины.

В отличие от фамилий на -ов или -ин, модель на -иди не склонялась по русским падежам, что создавало путаницу в документах. В советских паспортах её часто записывали с окончанием -и (Кояни) или русифицировали, добавляя -ев (Кояниев), но исходная форма сохранилась у тех, кто дорожил родовой памятью.

Таким образом, фамилия Кояниди — не просто указание на греческое происхождение, а связующее звено с прозвищем, которое могло рассказать о характере предка, и с историей целого народа, вынужденного покинуть родные берега.