Фамилия Кожагапарова — одна из тех, что выдают тюркское происхождение с казахскими корнями. Она образована по распространённой в казахской ономастике модели: к мужскому имени или прозвищу добавляют суффикс -ов/-ев, который русифицировал фамилию в XIX–XX веках, когда казахи входили в состав Российской империи и получали фамилии по отцу. Основа здесь — Кожагапар. Это составное имя: первая часть «кожа» (каз. қожа) восходит к персидскому слову «хваджа» — «господин», «хозяин», «наставник», а в тюркской среде так называли потомков пророка Мухаммеда (сейидов) или просто уважаемых, грамотных людей, часто из числа мулл и учителей. Вторая часть — «гапар» (Ғапар) — арабское имя, один из эпитетов Аллаха (аль-Гафур — «Всепрощающий»), но в быту оно могло стать личным именем. Таким образом, Кожагапар — это теофорное имя, означающее примерно «Господин, которого простил Аллах» или «Наставник Всепрощающего».

Женское окончание -а указывает, что перед нами вариант фамилии, который носят женщины. Мужская форма — Кожагапаров. В казахской традиции фамилии на -ов/-ев долгое время не были обязательными; их стали массово фиксировать в советский период, когда требовалась паспортная система. Поэтому конкретная семья с такой фамилией, скорее всего, происходит от предка по имени Кожагапар — возможно, аульного аксакала, муллы или зажиточного скотовода, которого в народе уважительно называли «кожа» за происхождение или знания.

Географически фамилия встречается прежде всего в Казахстане, особенно в южных и западных областях (Кызылординская, Туркестанская, Мангистауская), где сильны родоплеменные связи и чаще сохранялись имена с религиозным оттенком. В России носители — это потомки казахов, переехавших в соседние регионы (Оренбуржье, Астрахань, Алтай). Интересная деталь: двойной суффикс -ап-ар в имени (Кожа-гап-ар) нетипичен для русских фамилий, но для тюркских имён это обычный способ соединить два смысловых блока. Встречаются варианты написания через «х» (Хожагапаров) или с ударением на последний слог — это следствие разной записи в метриках и паспортах.

В отличие от многих фамилий, где основа угадывается с трудом, Кожагапарова прозрачна: любой носитель казахского языка сразу поймёт, что в роду был уважаемый человек, носивший имя Кожагапар. Это не ремесло и не прозвище по внешности, а прямая отсылка к имени предка — и в этом её ценность для семейной истории.