Фамилия Кожомкулов — один из ярких примеров тюркской модели образования фамилий на русский манер. Её основа — составное личное имя Кожомкул, которое бытовало у киргизов и некоторых других тюркских народов. Разберём его по частям.

Первая часть — «кожо» (варианты: ходжа, хожа). В тюркских языках это слово имеет несколько значений: «господин», «хозяин», а также почётный титул для потомков пророка Мухаммеда или для людей, совершивших хадж. В народной среде «кожо» могло стать частью имени как знак уважения к роду или как пожелание ребёнку стать уважаемым человеком. Вторая часть — «мукул» (в фамилии пишется как «мкул»). Это древнее тюркское имя, которое встречается в эпосе «Манас» и означает «крепкий», «надёжный», «верный». Сложносоставные имена (Кожомкул, Кожоберды, Кожоназар) были типичны для кочевых обществ: они несли в себе характеристику или благопожелание.

Фамилия образована по русской модели: к основе Кожомкул добавили суффикс -ов. Так в XIX — начале XX века записывали фамилии для киргизов и казахов, когда те входили в состав Российской империи и получали официальные документы. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Кожомкула» или «из рода Кожомкула».

Географически фамилия Кожомкулов почти исключительно киргизская. Встречается она в основном в Нарынской, Иссык-Кульской и Джалал-Абадской областях Кыргызстана. Есть и одноимённое село Кожомкул в Сузакском районе — названное, вероятно, в честь знатного или легендарного предка. Из-за того, что имя Кожомкул было популярно в разных родах, носители фамилии не обязательно являются близкими родственниками — это разные ветви, объединённые общим именем-предком.

В русском языке фамилия сохранила оригинальное тюркское звучание: ударение падает на последний слог — Кожомкуло́в. В киргизском произношении ударение может смещаться на первый слог. Иногда встречается написание «Кожомкулов» с двойным «л», но это ошибка — в основе одна «л», и вторая появляется только при склонении (Кожомкулу, Кожомкулом).

Если коротко: предки носителя этой фамилии — человек по имени Кожомкул, что можно перевести как «господин-надёжный» или «почтенный крепыш». Фамилия — не дворянская и не купеческая, а простонародная, крестьянская (кочевая), закреплённая в эпоху имперского делопроизводства.