Фамилия Козовякин — один из тех случаев, когда за привычным звучанием скрывается неочевидная история. На первый взгляд, корень «коз-» намекает на животное, но суффикс «-вяк-» здесь решающий. В русских говорах, особенно на юге и юго-западе, слово «козвяк» или «козявяк» означало не просто козу, а нечто мелкое, несуразное или даже докучливое — вроде назойливого насекомого. Позже это слово закрепилось за прозвищем: так могли назвать приставучего человека, егозу или того, кто постоянно «вякает» — то есть говорит без умолку или некстати. Таким образом, Козовякин — это не «сын козы», а потомок человека с прозвищем Козвяк (или Козовяка), которое со временем оформилось по стандартной русской модели: суффикс «-ин» указывает на принадлежность («чей?» — Козовякин).

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным областям России, особенно к Тульской, Рязанской и Воронежской губерниям. В этих краях диалектное слово «козявка» в значении «маленький, надоедливый человек» было в ходу, и фамилия могла возникнуть независимо в разных сёлах. Интересно, что в некоторых местных говорах «козвякать» означало «бренчать на плохом инструменте» или «капризничать», что добавляет прозвищу ещё один оттенок — несерьёзного, суетливого человека. Сословно Козовякины, скорее всего, были крестьянами или мещанами: фамилия не встречается в старых родословных книгах дворянства, что типично для прозвищ, образованных от бытовой лексики.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает эту версию. Козявкин, Козявко, Козвяков — все они происходят от того же корня, но с разными суффиксами. Козовякин стоит особняком из-за растянутой основы «Козовяк-», которая могла возникнуть как вариант произношения (через «о» вместо «а» под влиянием аканья) или как отдельное прозвище от глагольной формы «козовякать» — путаться, делать что-то неловко. В любом случае, фамилия не имеет отношения к козоводству или торговле козами: её носитель был просто человеком с характером, который окружающие запомнили ёмким словом.