Фамилия Коковякин — из тех, где основа неочевидна, а суффикс указывает на модель образования, характерную для северных и центральных областей России. Разберёмся по порядку.

Первое, что бросается в глаза, — суффикс -якин. Это нестандартная форма: в русских фамилиях чаще встречается -ов/-ев или -ин. Суффикс -якин (как в фамилиях Ширякин, Корякин, Бодякин) обычно образуется от прозвищ или имён, оканчивающихся на -яка: Коковяка, Ширяка, Коряка. То есть Коковякин означает «сын (или потомок) Коковяки».

Самая правдоподобная версия происхождения прозвища Коковяка связана с диалектным глаголом «коковать» или «коковять». В северных говорах (архангельских, вологодских, вятских) «коковать» означало «куковать» (о птице), а в переносном смысле — «горевать», «тосковать», «жить одиноко». Прозвище Коковяка могли дать одинокому, нелюдимому человеку, «бирюку». Слово «кок» также имеет значение «ком», «шишка», но в сочетании с суффиксом -яка вероятнее именно глагольная основа.

Встречается и другая гипотеза: от тюркского имени или прозвища Кок (синий, небесный) с русским суффиксом. Однако для фамилии Коковякин она слабая — тюркские заимствования обычно дают формы Коков, Кокин, а не Коковякин. К тому же суффикс -якин — исконно русский, и связывать его с восточными корнями без веских оснований не стоит.

Географически фамилия Коковякин привязана к Русскому Северу и Вятке. В переписях XVIII–XIX веков носители встречаются в Вятской губернии, в частности в Слободском и Глазовском уездах. Это были государственные крестьяне, реже — мещане. Сословно фамилия недворянская, что типично для прозвищной модели на -якин.

Таким образом, Коковякин — фамилия, которая прямо говорит о характере или образе жизни предка: «кукующий в одиночестве», «нелюдим». Она редкая и сохранила диалектный оттенок, который уже почти стёрся в современном языке.