Фамилия Кпрянцев относится к числу редких и неочевидных по происхождению. На первый взгляд, её основа «Кпрян-» не похожа ни на одно из распространённых русских имён или прозвищ, что сразу выделяет этот род среди множества фамилий на -ов/-ев.

Скорее всего, фамилия образована от прозвища или мирского имени Кпрян. В русской ономастике известна фамилия Копрянцев (с буквой «о» в корне), которая встречается чаще. Вероятно, Кпрянцев — это фонетический вариант, возникший из-за акающего произношения (когда безударное «о» звучит как «а» и на письме могло закрепиться без него). В таком случае основа «Копря» или «Копрян» может восходить к слову «копр» — так в некоторых говорах называли укроп, а также растение с сильным запахом. Прозвище Копря могли дать человеку, занимавшемуся огородничеством, торговлей зеленью, или же просто тому, кто любил эту пряность.

Другая версия, менее вероятная, но возможная для редкого написания: основа «Кпрян» могла возникнуть из имени или прозвища Кирьян (Кирьян — народная форма имени Кириан, от греческого «господин»). При быстром произношении и записи на слух «Кирьян» могло превратиться в «Кпрян» через выпадение гласного. Однако это предположение слабее, так как для фамилий от Кирьяна типичны формы Кирьянов, Кирьянцев.

Суффикс -цев указывает на типичную модель русских фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -ец/-ян. Формально фамилия Кпрянцев означает «сын Кпряна», то есть потомок человека по прозвищу Кпрян.

Фамилия крайне редкая. В современных базах данных она почти не встречается, что говорит о локальном бытовании, возможно, в одной или нескольких соседних деревнях. Носители такой фамилии, скорее всего, происходят из крестьянской среды центральной России, где акающие говоры были нормой, а прозвища по растениям и ремёслам — частым явлением.