Фамилия Красун образована от прозвища, которое могло указывать либо на внешность предка (миловидность, изящность, привлекательность), либо на его характер (порядочность, честность, доброта, отзывчивость). Однако есть и вторая, более конкретная версия: прозвище Красун могли дать человеку, чья работа была связана с окрашиванием тканей или кожи — то есть красильщику. В этом случае фамилия относится к «профессиональным» именованиям, которые прямо указывали на род занятий основателя рода.

Словообразовательно фамилия проста: основа «крас-» (от «красить» или «красный» в значении «красивый») плюс суффикс «-ун», характерный для прозвищ, описывающих человека по действию или свойству (ср. «говорун», «бегун»). Такая модель встречается нечасто: большинство русских фамилий на «-ун» застыли в форме прозвищ или отчеств без дополнительного патронимического суффикса, как у Красун.

Географически фамилия редкая, встречается преимущественно в южнорусских и украинских областях, где суффикс «-ун» был более продуктивен. В документах XVII–XVIII веков можно найти прозвище Красун в среде казачества и посадских людей — там фиксация внешности или ремесла была обычной практикой при составлении переписей.

Споров о происхождении фамилии почти нет: обе версии (внешность/характер и профессия) не противоречат друг другу, а просто описывают разные возможные источники одного и того же прозвища. Выбрать единственно верную без конкретных архивных записей о первом носителе невозможно, но профессиональная версия выглядит чуть убедительнее — прозвища по ремеслу давали чаще, чем по абстрактным качествам.