Фамилия Крышкина образована от прозвища Крышка, которое восходит к нарицательному «крышка» - «положенное сверху чего-либо, для прикрытия, закрытия». Крышками часто называли верхнюю одежду, а также дешевую кулевую рогожу, которая использовалась для покрытия товара. Кроме того, крышки - «Дмитриева суббота, поминки (от обычая покрывать могилу ризой)». Таким образом, прозвище Крышка мог получить либо человек, шивший верхнюю одежду, торговец, либо устроитель поминальных обрядов. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Крышка, со временем получил фамилию Крышкин.