Фамилия Кржановская почти наверняка польского происхождения, и её основа — топоним, а не личное имя или прозвище. В польском языке есть несколько мест с названием Кржанов (Krzanów) или Кржановице (Krzanowice), а также город Кшановице (Krzanowice) в Силезии. Корень этих названий — krzan, что по-польски означает «хрен» (растение). То есть исходно название поселения могло указывать на место, где рос хрен, или на прозвище первого поселенца, связанное с этим растением.

Модель образования типична для польской шляхетской ономастики: суффикс -ский/-ская (-ski/-ska) в женском роде. В мужском варианте фамилия звучала бы как Кржановский (Krzanowski). Такие фамилии чаще всего указывали на владельца поместья или выходца из соответствующего села. Крестьяне в Польше редко носили фамилии на -ский до XIX века, поэтому предки носительницы фамилии Кржановская, скорее всего, принадлежали к мелкой шляхте (застянковой) или к людям, получившим фамилию по месту жительства после отмены крепостного права.

Написание через «ж» (Кржановская) — это русская или украинская передача польского звука [ж] в корне. В оригинале фамилия пишется через RZ: Krzanowska. Такая транслитерация характерна для территорий бывшей Речи Посполитой, вошедших в состав Российской империи. Если бы фамилия была записана с мягким знаком (Кржаньовская), это указывало бы на более позднюю украинизацию.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что Кржановская — не самая частая. В Польше встречается вариант Кшановская (Krzanowska), где «ш» вместо «ж» — результат оглушения в некоторых диалектах. В России и Беларуси фамилия редкая и почти всегда указывает на польские корни предков, а не на восточнославянское происхождение. Никаких других версий, кроме топонимической, у этой фамилии нет — ни профессиональной, ни отчественной.