Фамилия Кржановский — это, скорее всего, упрощённый вариант написания более распространённой польской фамилии Кжижановский (Krzyżanowski). Переход сложного для русского уха сочетания «кж» в более простое «кр» — обычное дело при переносе фамилий из польского языка: звук [ж] в стечении согласных просто выпал, а «ы» редуцировалось. В основе обеих фамилий лежит польское слово krzyż — «крест». От него образованы названия множества населённых пунктов в разных воеводствах Польши: Кжижанов, Кжижаново, Кжижановичи. Человек, получавший прозвище Кжижановский, указывал на своё происхождение — он был выходцем из одного из таких мест, владельцем или жителем «крестового» села. Такая модель образования фамилий (от названия поместья или местечка с суффиксом -ский) была типична для польской шляхты, но со временем распространилась и среди других сословий. Следы этой фамилии в России встречаются в документах XX века: например, Маргарита Ивановна Кржановская родилась в 1914 году, Казимир Альфредович Кржановский — в 1893-м в Мешковице (Тарнопольский район Польши), а Рафаил Николаевич Кржановский — в 1905 году в деревне Шмутово Ивановской области. Эти записи показывают, что носители фамилии жили как в западных губерниях, так и в центральной России.