Фамилия Кржижевская звучит по-польски, и это ключ к её разгадке. Её основа — польское слово krzyż, то есть «крест». Фамилия образована от названия населённого пункта вроде Кшиж (Krzyż) или Кшижево (Krzyżewo) с помощью типичного польского суффикса -евск-/-овск-. Форма Кржижевская — это русифицированная или украинизированная передача польского написания: в польском языке сочетание «rz» читается как твёрдое «ж», а «ż» как мягкое «ж» или «ш». Поэтому в русском варианте появилось двойное «жж», хотя в оригинале там один звук.

Слово «крест» в основе указывает не на ремесло плотника или ювелира, а на топографию или церковную историю. Кржижевскими чаще всего называли людей, которые жили в селе или местечке, названном в честь креста — возможно, стоявшего на перекрёстке дорог, на месте часовни или в память о каком-то событии. Такие названия распространены в Польше, Беларуси и на западе Украины, где была сильна польская шляхетская традиция. Фамилии на -ский/-цкий в этой среде указывали на принадлежность к определённой местности, часто — на дворянское происхождение, но не обязательно: крестьяне тоже могли получить такую фамилию по месту жительства при отмене крепостного права.

Мужской вариант — Кржижевский. В польском языке он звучал бы как Кшижевский (Krzyżewski), и это одна из распространённых фамилий в Польше. В России и Украине форма с «Крж» закрепилась из-за особенностей передачи польских звуков в кириллице. Встречаются и однокоренные варианты: Кржижановский, Крживицкий, Кшижановский — все они восходят к тому же корню «крест». Разница в суффиксах (-ановск-, -ицк-) говорит о разных конкретных сёлах или усадьбах, от которых пошли эти фамилии.

Сословная принадлежность предков Кржижевских могла быть разной. Если фамилия старая, документально засвидетельствованная с XVI–XVII веков, это почти наверняка шляхта герба (например, Ястршембец или Лелива, где крест — частый элемент). Но многие носители этой фамилии — потомки крестьян или мещан, которые получили фамилию при реформах XIX века по названию своей деревни. Без генеалогического исследования сказать точнее нельзя: фамилия не даёт гарантии благородного происхождения, но почти всегда привязывает род к конкретному месту на карте бывшей Речи Посполитой.