Фамилия Кстенин — редкая и морфологически прозрачная. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей сын?» — Кстенин, то есть сын Кстени. В основе лежит прозвище или некалендарное имя Кстеня. Вопрос в том, что это имя означало.

Самая надёжная версия отсылает к диалектному глаголу «кстенить» — в некоторых говорах (прежде всего северных и сибирских) это значит «хлопотать, суетиться, делать что-то с трудом, с натугой». Соответственно, Кстеня — человек, который всё делает с усилием, кряхтя и напрягаясь, либо, наоборот, суетливый, непоседливый работник. Такое прозвище могли дать в крестьянской среде за манеру поведения или за походку.

Вторая версия, менее вероятная, но встречающаяся в любительской ономастике, связывает корень «кст-» со словом «кстати». Мол, Кстеня — тот, кто всегда вовремя, к месту. Но лингвистически это слабо: слово «кстати» имеет другую структуру (от местоимения «к» и «стати»), и прозвища от наречий в русской традиции единичны и спорны.

Географически фамилия Кстенин тяготеет к Вологодской и Архангельской областям, а также к Уралу — именно там фиксируются говоры со словом «кстенить». Встречается она редко, в списках массовых фамилий не значится. Сословно её носители, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами: суффикс -ин у фамилий такого типа указывает на бытовое, нецерковное прозвище, а не на книжное имя.

Кстенин — фамилия, которая сохранила в себе живую диалектную лексику. Если ваш предок был Кстеня, то, по всей видимости, он отличался заметной манерой работать или двигаться — с натугой, с кряхтением, но настойчиво.