Фамилия Ктоян — типичный пример армянской модели образования фамилий, и её разбор стоит начать с суффикса. В подавляющем большинстве армянских фамилий используется суффикс -ян (или -янц в старой форме), указывающий на принадлежность к роду или происхождение. Ктоян означает «из рода Кто» или «потомок Кто». Основа «Кто» в данном случае — это, скорее всего, неполная или сокращённая форма личного имени.

Самая вероятная версия: «Кто» — это усечённый вариант армянского имени Ктор (или Кторян), которое, в свою очередь, восходит к древнеармянскому «ктор» — «сильный, могучий». В армянской ономастике нередко встречаются случаи, когда полное имя сокращалось до первого слога или корня, а затем к нему добавлялся фамильный суффикс. Таким образом, Ктоян могло означать «из рода сильного человека» или «потомок Могучего».

Менее распространённая, но не исключённая версия связывает основу с прозвищем. В диалектах армянского языка слово «кто» могло иметь иное значение — например, «упрямый» или «коренастый», но эта версия слабее подкреплена письменными источниками. Словарь армянских фамилий (работы А. Ачаряна и других ономатологов) указывает на преобладание антропонимического, то есть лично-именного, происхождения для фамилий с корнем «Кт-».

Географически фамилия Ктоян наиболее распространена в Армении, а также среди армянских диаспор в России, Грузии и Иране. В России она встречается в основном в Краснодарском крае, Ставрополье и Ростовской области — регионах с исторически сложившимися армянскими общинами. Социальный состав носителей фамилии был разнородным: среди Ктоянов были и крестьяне, и ремесленники, и священнослужители, но однозначно выделить «дворянскую» или «крестьянскую» ветвь по одной фамилии невозможно — для этого нужны генеалогические данные конкретной семьи.

Интересная деталь: в старых записях XIX века фамилия могла писаться как Ктоянц — с сохранением более архаичного суффикса, обозначавшего множественное число («из рода Кто»). Со временем конечное «ц» отпало, и форма Ктоян стала общеупотребительной. Если встретите вариант Ктоянц в метрических книгах — это не ошибка, а более ранняя форма записи.