Фамилия Ктрейченкова выделяется даже на фоне сложных славянских фамилий. Её основа — Ктрейченко — почти не встречается в современных справочниках, а значит, перед нами либо редчайшая локальная форма, либо результат искажения исходной фамилии при записи.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -енк- (украинский патронимический, «малый», «сын такого-то») и женский суффикс -ов-. Мужской вариант — Ктрейченко. Основа Ктрейч- не имеет прямых соответствий в славянской лексике. Вероятнее всего, это фонетическое переосмысление фамилии на -ейко или -енко. Например, фамилия Котрейченко (от прозвища Котрей — вариант имени Дмитрий в просторечии, ср. Котря, Котрей) могла потерять первую гласную «о» из-за аканья или небрежного произношения. Также возможна связь с диалектным глаголом «котрыжить» (ерзать, вертеться) — тогда Ктрейч было бы прозвищем непоседы.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским областям, где суффикс -енко обычен. Однако в переписях XIX века она не зафиксирована — это указывает на то, что её носители могли быть крестьянами или мещанами, не попавшими в дворянские родословные книги. В современных базах данных единичные записи встречаются в Курской и Белгородской областях.

Спор о происхождении корня можно разрешить, обратившись к принципу «бритвы Оккама»: проще всего предположить, что Ктрейченко — это сокращённая форма от Котрейченко, где «о» отпало в безударном положении. Другие версии (от тюркского «ктер» или греческого «ктерос») требуют натяжек и не подтверждаются ареалом бытования.

Таким образом, носитель фамилии Ктрейченкова может считать своим предком человека по прозвищу Котрей (уменьшительное от Дмитрий) или Ктрейч (возможно, от диалектного слова). Фамилия — редкий пример того, как живая речь «съела» часть звуков, оставив нам необычное сочетание согласных в начале.