Фамилия Кубилюс — одна из тех, что сразу выдают литовские корни. В отличие от множества русских фамилий на -ов/-ев или -ин, окончание -ус (как и -ас, -ис) — типичный литовский патронимический суффикс. Он указывает на происхождение от отца: Кубилюс буквально означает «сын Кубиласа» или «потомок Кубилы». Основа фамилии — личное имя или прозвище Kubila, которое в свою очередь могло произойти от литовского kubilas — «кадка», «ушат», «большая деревянная посудина». Вряд ли это прямое указание на профессию бондаря (хотя и не исключено), скорее — прозвище крупного, полного человека, которого в шутку сравнивали с кадкой.

Фамилия сравнительно редкая за пределами Литвы. На территории бывшей Российской империи она встречается в основном в западных губерниях — Ковенской, Виленской, Сувалкской, где исторически жили литовцы. После присоединения Литвы к России в конце XVIII века литовские фамилии записывались по русскому образцу, но суффикс -ус часто сохраняли, не русифицируя, — в отличие, скажем, от польских фамилий на -ский, которые переделывали на русский лад.

Интересная деталь: в литовской ономастике есть и вариант Кубилас (с окончанием -ас), и Кубилис (с -ис). Форма Кубилюс — самая распространённая, она образована по продуктивной модели отчества: к основе добавляется суффикс -iūnas, который в разговорной речи стянулся в -ius. В русской передаче XIX века это часто писали как Кубилюсъ, с твёрдым знаком на конце.

Сословной принадлежности у фамилии нет: Кубилюсы могли быть и крестьянами, и мещанами, и шляхтой. Литовское дворянство нередко имело фамилии на -ус, но без герба и подтверждения статуса сказать что-то определённое невозможно. Главное, что стоит запомнить: если ваша фамилия Кубилюс, ваши предки — из Литвы, и их родоначальника прозвали Кадкой.