Фамилия Кудабиене — почти наверняка литовская, и это сразу видно по её окончанию. В русском языке фамилии на «-ене» не образуются, а в литовском это типичный женский суффикс, указывающий на замужнюю женщину. Мужской вариант этой фамилии будет Кудабис (Kudabis) или Кудаба (Kudaba). Если вы встретили Кудабиене у женщины, то её муж или отец, скорее всего, носил именно такую основу.

Корень «Кудаб-» в литовском языке не имеет однозначного и прозрачного значения. Скорее всего, он восходит к древнему личному имени или прозвищу. Можно предположить связь с литовским словом «kudėti» — «коптить», «дымить», или с «kudulas» — «клок», «пучок». В таком случае прозвище Кудабис могли дать либо человеку, который постоянно находился в дыму (кузнец, печник), либо тому, кто носил неопрятную, торчащую одежду или волосы.

Литовские фамилии активно формировались в XV–XVII веках. Кудабис — это, скорее всего, прозвищная фамилия, то есть её дали не по отцу, а по характерной черте самого первого носителя. Поскольку фамилия редкая и не имеет широкого распространения в России, её носители почти наверняка происходят из исторической Литвы или прилегающих районов Беларуси (где литовский ономастический след силён). Встретить Кудабиене в чисто русских областях практически невозможно — это маркер балтского происхождения семьи.