Фамилия Кудбеев — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа, скорее всего, не славянская, а тюркская. В пользу этого говорит характерный суффикс -ев, который в русских фамилиях часто присоединялся к нерусским основам (ср. Ахметев, Муратов). Если бы фамилия была исконно русской, мы бы ожидали суффикс -ов или -ин, но здесь мы видим именно -ев, что типично для адаптации тюркских имён и прозвищ.

Корень «Кудбей» можно разложить на две части: «куд» и «бей». В тюркских языках «бей» (или «бий», «бек») — это титул знатного человека, князя, господина. Первая часть «куд» менее прозрачна. Вероятнее всего, это искажённое «кут» — в тюркской мифологии и языке это слово означает «душа», «счастье», «благодать», «жизненная сила». Таким образом, «Кутбей» могло быть составным именем-пожеланием: «счастливый господин», «благодатный князь». Не исключено, что в основе лежит и имя Кудбай, где «бай» — также «богач», «хозяин», а «куд» — вариант того же «кут».

Географически фамилия Кудбеев почти наверняка указывает на регионы, где исторически жили тюркские народы: Татарстан, Башкортостан, северный Кавказ (особенно осетины, у которых много фамилий на -ев), или же на астраханских и оренбургских татар. Встречаемость фамилии крайне низкая, что говорит о локальном происхождении — возможно, от названия конкретного аула или рода. В русских переписных книгах XVII–XVIII веков такие фамилии не фиксируются, потому что крестьяне и служилые люди из тюркской среды получали их позже, при переходе в православие и оформлении сословной принадлежности.

Спорных версий здесь немного. Вряд ли «Кудбеев» происходит от русского слова «куд» (в диалектах — вихрь, колдовство) или от «кудри» — слишком далека семантика, и суффикс -ев тогда необъясним. Альтернатива с осетинским корнем «куд» (как, «как») тоже маловероятна: осетинские фамилии обычно строятся иначе. Самая надёжная гипотеза — тюркское составное имя с пожеланием благополучия, которое после крещения или русификации превратилось в фамилию. Предки Кудбеевых могли быть служилыми татарами, башкирскими вотчинниками или осетинскими алдарами (знатью), но точных данных об их социальном статусе нет — фамилия слишком редкая для широких исторических обобщений.