Фамилия Кудытин — одна из тех, где ключ к разгадке лежит не в корне, а в суффиксе. На первый взгляд основа «Кудыт» кажется тёмной, но стоит присмотреться к модели образования: суффикс -ин указывает на принадлежность. Это типичная «патронимическая» фамилия, то есть образованная от имени или прозвища отца: «чей?» — Кудытин, то есть сын Кудыты.

Само имя Кудыта — это, скорее всего, народная, диалектная форма крестильного имени Никита. В русских говорах, особенно на севере и в центральных областях, имя Никита нередко произносили как «Микита», а от него образовывали уменьшительные варианты. Чередование «М» и «К» в начале слова встречается в живой речи (сравните: «Михаил» и народное «Кузьма» — от греческого «космас»). Так вполне могло появиться имя Кудита или Кудыта. К слову, в словаре древнерусских имён встречается форма «Кудим» как вариант от Никита, что подтверждает такую возможность.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая, связывает фамилию с прозвищем от диалектного глагола «кудыкать» — то есть спрашивать «куда?», быть назойливым, любопытным. В этом случае Кудыта — человек, который вечно суёт нос не в своё дело. Однако против этой гипотезы говорит редкость такого прозвища: обычно в основе фамилий лежат более конкретные признаки внешности или ремесла, а не отвлечённые черты поведения.

Географически фамилия Кудытин — редкая, её очаги можно проследить в Вологодской и Архангельской областях. Это как раз зона бытования северных говоров, где сохранялись архаичные формы имён. Социальный состав предков, скорее всего, — крестьяне-северяне, свободные землепашцы или ремесленники. Фамилия не дворянская и не купеческая, а типичная для простого сословия, что подтверждается её словообразовательной моделью — без суффиксов -ов/-ев, характерных для более «верхних» слоёв населения.