Фамилия Кумпэнэ — редкий случай, когда иноязычная основа сохранила своё написание почти без изменений, а суффиксальная русская обработка отсутствует. В русском ономастиконе фамилии с конечным -э встречаются единично и почти всегда указывают на недавнее происхождение от западноевропейских или балканских корней. Кумпэнэ, скорее всего, восходит к румынскому (молдавскому) слову cumpănă — «весы», «коромысло» или «равновесие». В переносном смысле так могли называть человека рассудительного, уравновешенного или того, кто работал с весами — торговца, менялу, сборщика податей.

Фонетически фамилия могла возникнуть и от глагола a cumpăni — «взвешивать», «обдумывать». Если предок был носителем прозвища Кумпэнэ, это могло означать не только профессию, но и характер: медлительного, осторожного человека, который всё «взвешивает». В Молдавии и на юго-западе Украины такие прозвища фиксировались в XIX веке, но в письменных источниках они почти не сохранились из-за малого числа грамотных носителей.

В отличие от большинства русских фамилий, Кумпэнэ не получила суффиксов -ов или -ин — это говорит о том, что она закрепилась в документах уже в готовом виде, без адаптации. По сословной принадлежности носители могли быть крестьянами или мещанами бессарабских губерний, реже — казаками. В современной России фамилия встречается единично, в основном в Краснодарском крае и Ростовской области, куда переселялись молдавские крестьяне в конце XIX — начале XX века.

Спорных версий немного: иногда Кумпэнэ путают с тюркскими фамилиями на -э, но корень здесь явно романский, а не тюркский. Учитывая, что румынское cumpănă имеет латинское происхождение (от campana — «колокол», по сходству формы коромысла с дугой колокола), фамилия Кумпэнэ — редкий пример, когда прозвище, связанное с конкретным предметом быта, перешло в фамилию без изменений и сохранило архаичное звучание.