Фамилия Купневский образована по типичной для восточнославянских фамилий модели с суффиксом -ск(ий). Этот суффикс чаще всего указывает на связь с географическим названием: владельческий или дворянский статус (как у князей и шляхты) либо просто происхождение из конкретного места. В основе фамилии лежит топоним Купнево или Купнев — название села, деревни или урочища. Такие названия встречаются в Беларуси и на западе России, в частности в Витебской области есть деревня Купнево. Корень «куп-» в славянской топонимике может восходить к слову «купить» (земля, купленная у кого-то) или к диалектному «купня» — место, где торгуют, рынок. Менее вероятна связь с личным именем Купня (от «купец» или прозвища торговца), но для фамилий на -ский первичным обычно служит именно географический объект.

Фамилия Купневский — относительно редкая. В отличие от массовых фамилий на -ов/-ев, она не указывает на прямого родоначальника по имени, а скорее говорит о том, что первые носители были выходцами из поселения Купнево или владели им. В историческом контексте такие фамилии часто принадлежали мелкопоместной шляхте или крестьянам, получившим фамилию по месту жительства при переписях. В документах XIX века фамилия встречается преимущественно на территории современных Беларуси и Смоленской области, что подтверждает её западнорусское происхождение.

Если рассматривать альтернативную версию, можно предположить, что основа «Купнев» могла быть отчеством от прозвища Купень (от «купить» или «купа» — скопление, куча), но суффикс -ский всё же сильнее склоняет к топонимическому объяснению. В любом случае, носитель фамилии Купневский может с высокой долей вероятности считать своими предками жителей одного из сёл с корнем «Купн-» на западе России или востоке Беларуси.