Фамилию Кушилкина стоит разбирать с её финального суффикса -ин. Эта модель в русских фамилиях означает «чей?» — то есть указывает на родство или принадлежность: Кушилка — человек, которого так прозвали, а Кушилкин — его сын или потомок. Форма Кушилкина — это женский вариант, но исторически фамилия закрепилась за родом в мужском роде: Кушилкин.

Основа фамилии — прозвище Кушилка. Здесь мы сталкиваемся с редким и неочевидным корнем. В русских говорах слово «кушилка» не фиксируется как общеупотребительное, и это заставляет искать более глубокие связи. Самая вероятная версия — связь с диалектным глаголом «кушить» или «кушать». В некоторых южнорусских и украинских говорах «кушити» означало «пробовать», «отведывать», а также «приучать к чему-либо». Прозвище Кушилка мог получить человек, который любил поесть, или, наоборот, тот, кто кого-то прикармливал, приручал. Менее вероятный, но возможный вариант — искажение от «кушак» (пояс) или «кушак» — ремесленника, делавшего пояса, но для этого требовался бы суффикс -к- в иной функции.

С географической точки зрения фамилия Кушилкина встречается редко, что говорит о локальном происхождении. Основные очаги — центральные и южные регионы России, где диалектная лексика сохраняла такие архаичные формы. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми — прозвищные фамилии на -ин редко встречались у дворянства, которое предпочитало модели на -ский или -ов.

Таким образом, Кушилкин — это «внук Кушилки». Прозвище Кушилка, вероятно, описывало человека по его отношению к еде или к процессу кормления, приручения. Фамилия не имеет отношения к тюркским или финно-угорским корням, как можно было бы предположить по звучанию, и является исконно русским образованием от диалектного глагола.