Фамилия Куспеков происходит от казахского личного имени Куспек, и её разбор — это история о том, как в одном имени могли столкнуться печаль и власть, кочевой быт и титул. Имя Куспек составное: первая часть, «кус», скорее всего, восходит к казахскому «куса» (печаль) или к башкирскому «кусеу» (кочевать, переходить с места на место). Вторая часть — «пек» — это фонетический вариант тюркского «бек», то есть «господин», «князь». Буквальное значение имени получается двойственным: «печальный господин» или «странствующий бек». Обе версии не противоречат друг другу: имя могли дать с пожеланием серьёзности и высокого положения, а могли и по обстоятельствам, связанным с переездами семьи.

Модель образования фамилии проста и типична для тюркских народов: к основе Куспек прибавили русский патронимический суффикс -ов, который в XIX–XX веках массово использовался при русификации казахских фамилий. Таким образом, Куспеков — это буквально «сын Куспека» или «потомок Куспека». Фамилия не получила широкого распространения за пределами Казахстана и встречается преимущественно у казахов, а также у башкир и татар, что подтверждает её тюркские корни.

Существует и топонимическая версия: прозвище Куспек мог получить выходец из села Куспек в Казахстане. Однако она менее вероятна, так как само название села, скорее всего, вторично по отношению к имени основателя или первопоселенца. Спорный элемент «кус» допускает и другие трактовки — в некоторых тюркских языках «кус» означает «птица», но для данной фамилии это значение не подтверждается историческими данными и выглядит натяжкой.

В отличие от многих русских фамилий, образованных от крестильных имён, Куспеков несёт в себе не христианскую, а доисламскую тюркскую традицию имянаречения, где имя могло отражать черту характера или жизненное обстоятельство. Сословной привязки у фамилии нет: Куспековы могли быть и кочевниками-скотоводами, и оседлыми крестьянами, и, при удаче, представителями степной знати — всё зависело от того, кем был конкретный носитель имени Куспек.