Фамилия Куспакова образована по стандартной русской модели от мужской формы Куспаков, где суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Куспака). Основа здесь — редкое личное имя или прозвище Куспак. Обычно такие фамилии закреплялись за потомками человека, которого в документах записали Куспаком.

Корень фамилии — тюркский. Скорее всего, в основе лежит слово «кус» (птица) с добавлением уменьшительно-ласкательного аффикса -пак, характерного для казахского, башкирского или татарского языков. В этом случае Куспак — «птичка», «птенчик» или ласковое прозвище человека, похожего на птицу (лёгкого, быстрого, певчего). Вторая версия, менее вероятная: «кус» может означать «гнев», «ярость», тогда прозвище давали вспыльчивому человеку.

По географии фамилия Куспакова встречается преимущественно в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане — регионах, где веками жили тюркские народы и происходила ассимиляция их имен в русскую фамильную систему. Это указывает на то, что предки носителей фамилии, вероятно, были башкирами, татарами или казахами, а в XVIII–XIX веках их потомков записывали в русские метрические книги уже с фамилией на -ов.

С точки зрения словообразования фамилия интересна тем, что сохранила редкий аффикс -пак, который в русских фамилиях почти не встречается. Обычно тюркские имена переходили в русские фамилии с более частотными суффиксами (-бай, -бек, -гали), а здесь мы видим именно уменьшительную форму, что делает фамилию Куспакова уникальным примером переноса бытового прозвища, а не официального имени.