Вероятно, фамилия Кууск образована от аналогичного имени, в основе которого лежит эстонское слово kuusk - «ель», «сосна». С давних времен у многих народов ель имела важное символическое значение. По легенде, ель укрыла Богородицу во время ее бегства с Христом в Египет или Христа, прятавшегося от чумы, за что получила благословение и была вознаграждена, оставшись навечно зеленой. Также не исключено, что в основе этой фамилии лежит прозвище. Возможно Кууском прозвали человека, который жил рядом с еловым лесом.