Фамилия Куйчиев — редкий случай, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает все прочие версии. В основе лежит тюркское слово «куйчи» (или «куйчи» с разным произношением), которое в Средней Азии, особенно в Узбекистане и Таджикистане, означало «баранщик» или «пастух овец». Это не просто прозвище, а обозначение конкретного занятия: человек, который пасёт отару, знает толк в овцах, а не просто держит пару голов. Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ев, который присоединили к основе «Куйчи»: так тюркское прозвище превратилось в русскую фамилию.

Суффикс -ев указывает на то, что фамилия оформлялась в русскоязычной среде, скорее всего, при переписях или выдаче паспортов. Если бы фамилия осталась в исконной тюркской форме, она звучала бы как Куйчиев (с ударением на второй слог) или Куйчиев (с ударением на последний), но русская модель сдвигает ударение на корень: Ку́йчиев. Это типичная история для фамилий народов Средней Азии и Кавказа, которые попали в орбиту Российской империи и получили русское окончание.

Встречается фамилия в основном в Узбекистане, Таджикистане, а также среди выходцев из этих регионов в России. Есть и другой, менее вероятный вариант: исходное слово могло быть связано с тюркским «куй» — «песня» или «напев», и тогда «куйчи» — это певец или музыкант. Но эта версия слабее: для обозначения музыканта в тех же языках чаще употребляли «хафиз» или «ашуг», а прозвище по роду занятий «пастух» — одна из самых распространённых основ в крестьянских фамилиях. Куйчиев — фамилия, которая прямо говорит о том, чем занимался основатель рода: пас овец где-нибудь в предгорьях или на равнинах между Сырдарьёй и Амударьёй.