Фамилия Кузбагаров — составная, и её стоит разбирать по частям, а не искать единый корень. Первая часть, «Куз», восходит к древнетюркско-татарскому мужскому имени Куз со значением «глаз». В тюркской антропонимии такие имена, связанные с частями тела, не редкость: они могли даваться как оберег или указывать на особую примету, зоркость.

Вторая часть, «Багар», — это искажённая или диалектная форма арабского имени Багар (Бахар), что переводится как «весна». В мусульманской культуре имя Багар не было редкостью: весна символизировала молодость, обновление, начало полевых работ. В народном сознании это время года нередко связывали с любовными отношениями и плодородием, а божественными олицетворениями весны выступали Венера и Флора. В европейской живописи XVIII века весну изображали в виде молодых влюблённых, разбрасывающих цветы, а атрибутом весны часто служили птицы.

Словообразовательная модель фамилии типична для русской среды: к тюркско-арабскому составному имени Кузбагар добавили русский патронимический суффикс -ов. Таким образом, Кузбагаров буквально означает «потомок Кузбагара». Фамилия могла закрепиться в среде татар, башкир или других тюркских народов, принявших православие или долгое время живших в русскоязычном окружении. Географически она тяготеет к регионам Поволжья и Приуралья, где подобные гибридные фамилии — обычное дело. Встречаются и варианты написания, например, Кузбагаров с ударением на последний слог, что характерно для русской адаптации тюркских фамилий.