Фамилия Кузюмузю — редкий случай в русской ономастике. С первого взгляда она напоминает украинские или южнорусские фамилии-прозвища, построенные на звукоподражании или рифме. Однако её структура не вписывается в привычные модели: нет суффиксов -ов, -ин, -ский, -енко, -ук. Это указывает на то, что фамилия могла быть записана в «чистом» виде, без патронимического оформления, что характерно для прозвищ, закрепившихся в устной речи.

Самая вероятная версия происхождения — прозвище, основанное на глаголе «кузюкать» или «кузюмкать». В некоторых говорах (например, в рязанских и тамбовских) «кузюкать» означает «говорить невнятно, бормотать, мямлить». Повтор «музю» мог усиливать звукоподражательный эффект: «кузю-музю» — нечто нечленораздельное, похожее на детский лепет или шёпот. Таким образом, Кузюмузю — прозвище неразговорчивого, застенчивого или косноязычного человека.

Менее убедительна связь с тюркскими корнями. В некоторых тюркских языках есть слово «кузю» (глаз) и «музю» (рог), но сочетание выглядит искусственным и не даёт осмысленного прозвища. Скорее всего, это народная этимология, возникшая из-за экзотического звучания. Географически фамилия встречается крайне редко, в основном в документах XIX века из Курской и Воронежской губерний, где были сильны традиции прозвищ-повторов (ср. «Тютю», «Ляля», «Бубу»). В современной России фамилия практически исчезла, что делает её уникальным свидетельством местной диалектной речи.