Фамилия Кузюткина — женская форма фамилии Кузюткин, и её разговорная, простонародная основа сразу бросается в глаза. В отличие от «элитных» фамилий на -ский или книжных на -ов, здесь работает старинная уменьшительно-ласкательная модель.

Корень фамилии — «куз-», который восходит к слову «кузня» (кузница) и глаголу «ковать». Но не торопитесь записывать предка в кузнецы: суффикс -ютк- (или -утк-) в русских фамилиях встречается редко и обычно указывает на прозвище, а не на профессию. В народной речи «кузютка» могли назвать маленького, юркого человека, который постоянно что-то мастерит, «кует» — то есть суетится, стучит, работает руками. Сравните с фамилиями Ковалёв (профессиональная) и Ковальчук (украинский вариант) — здесь иная стилистика.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России (Архангельская, Вологодская, Костромская области), где суффикс -утк-/-ютк- был особенно жив в диалектах. В письменных источниках, например, в переписных книгах XVII века, встречаются прозвища Кузютка, Кузютко — это не официальное имя, а домашнее, уличное.

Версия о происхождении от крестильного имени Кузьма (через форму Кузютка) возможна, но менее вероятна: от Кузьмы обычно образовывали Кузьмин, Кузенков, Кузьмичёв. Форма Кузюткин стоит особняком — она подчёркивает именно прозвищный, бытовой характер. Носитель этой фамилии мог быть не столько кузнецом по ремеслу, сколько человеком с прозвищем «Кузютка» — за шумный нрав или любовь к возне с металлом.