Фамилия Кысов — редкая и неочевидная. Её основа, корень «кыс-», не встречается в списке типичных древнерусских имён или прозвищ, поэтому первое, что приходит в голову, — поискать тюркские следы. И действительно, в татарском, башкирском и других тюркских языках «кыс» (qız) означает «девочка», «дочь». Фамилия Кысов могла образоваться от прозвища Кыс, которое давали, например, единственной дочери в семье или, наоборот, мальчику, которого воспитывали как девочку (такие случаи в патриархальной среде встречались, если в семье долго не было сыновей). Модель образования проста: к основе «Кыс» добавили русский патронимический суффикс «-ов», что значит «сын Кыса» или «потомок Кыса».

Суффикс «-ов» указывает на то, что фамилия сформировалась в русской среде, но её носителями могли быть крещёные татары, башкиры или чуваши. В этих культурах имя Кыс (или Кыз) фиксировалось как личное, хоть и редко. В словаре тюркских имён есть форма Кызбикә (девочка-госпожа), но без уменьшительного суффикса «Кыс» — скорее прозвище, чем каноническое имя.

Есть и другая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование: фамилия могла произойти от диалектного слова «кыс» в значении «кислый» или «кислятина». В некоторых говорах русского Севера (архангельские, вологодские) «кыс» — это закваска или прокисшее тесто. Тогда прозвище Кыс мог получить человек, постоянно делавший кислую выпечку, либо брюзга с «кислым» лицом. Однако географически эта версия слаба: фамилия Кысов чаще встречается в Поволжье и на Урале, где тюркское влияние сильнее, чем на Русском Севере.

Что касается сословной принадлежности, определённых данных нет. Кысовы могли быть и крестьянами, и мещанами, и служилыми людьми из «инородцев». В дореволюционных метрических книгах по Казанской и Уфимской губерниям фамилия изредка мелькает, но массовой не стала. Носителей Кысовых в России сегодня — единицы, и это делает фамилию уникальным маркером: если вы Кысов, ваши корни почти наверняка уходят в тюркскую среду, а предок носил прозвище, связанное с дочерью или женским началом.