Фамилия Кытюшко — редкий случай, когда географический и языковой след почти очевиден, но точное значение ускользает. Её основа — «кытюш» — явно не из славянского лексикона. Скорее всего, это адаптация тюркского или, что вероятнее, финно-угорского слова. В коми-пермяцком языке есть слово «кыт» — «место», «где», а суффикс «-юш» мог быть уменьшительным или прозвищным. Также можно вспомнить удмуртское «кыт» — «кожа», «шкура». В таком случае Кытюш — человек, связанный с кожевенным делом или прозванный по какому-то качеству, связанному с кожей.

Суффикс «-ко» в фамилии — типичный украинский или белорусский показатель, указывающий на уменьшительность или принадлежность. По модели образования Кытюшко — это «сын Кытюша» или «маленький Кытюш». Сама фамилия почти не встречается за пределами нескольких регионов. Её можно найти преимущественно на западе Украины, особенно в бывших пограничных землях Речи Посполитой, где смешивались славянские и тюркские влияния. Возможно, предок носителя фамилии был переселенцем из Поволжья или Приуралья — оттуда, где финно-угорские народы соседствовали с русскими и татарами.

Сравнение с однокоренными фамилиями вроде Китюк, Китюхин или Кутышко показывает, что корень «кыт» может варьироваться в написании из-за диалектного произношения. В документах XVIII–XIX веков такую фамилию могли записать на слух — отсюда и её редкость. Кытюшко не принадлежала к дворянству или духовенству: скорее всего, это фамилия крестьянской или казачьей семьи, которая сохранилась в узком локальном кругу. Точно сказать, что она означала изначально, сложно — слишком много вариантов, но связь с финно-угорским миром выглядит наиболее обоснованной.