Фамилия Ладожинская — женская форма фамилии Ладожинский, и её ключ к происхождению — не столько в корне «Ладож-», сколько в суффиксе. Фамилии на -ский/-ской в русской традиции — это почти всегда указание на местность или владение. Так образовывали фамилии дворяне по названиям своих имений (например, Вяземский — от Вязьма) или выходцы из сёл и городов. Основа «Ладож-» прямо отсылает к Ладоге — древнему городу на Волхове (ныне Старая Ладога) или к Ладожскому озеру. Человек с такой фамилией, скорее всего, происходил из тех мест: либо родился в Приладожье, либо его предок владел землёй с таким названием.

Но есть тонкость. В русских документах XVI–XVII веков фамилии на -ский нередко давали не только дворянам, но и духовенству — по названию храма или монастыря. Ладога была крупным религиозным центром: там стояли Николо-Медведский монастырь и Успенский собор. Священник или дьячок, служивший при «ладожской» церкви, мог получить фамилию Ладожинский. В этом случае суффикс -ин- в середине слова (Ладож-ин-ский) — не ошибка, а указание на принадлежность: «ладожинский» буквально значило «относящийся к Ладоге» или «ладожский», но с притяжательным оттенком, как «сын ладожанина».

Встречается и бытовая версия: прозвище Ладога или Ладожа могли дать человеку, который торговал с Ладогой, ходил туда на промысел или просто был родом оттуда. От такого прозвища через суффикс -ин- (Ладожин — «чей?» — «сын Ладожи») и образовали фамилию Ладожинский. Вариант с -ская — это уже женская форма, закрепившаяся в документах за дочерью или женой носителя фамилии.

Географически фамилия редкая и локальная. Основные следы — на северо-западе России, в Новгородской и Ленинградской областях, а также в среде петербургского духовенства XIX века. В дворянских родословных книгах Ладожинские не числятся — скорее всего, это фамилия мещанского или церковного сословия. Точных дат появления нет, но по модели образования фамилия могла сложиться не позднее XVII века.