Фамилия Латогузов образовалась от прозвища Латогуз, и её происхождение уходит корнями не в славянские, а в балтийские языки. На это указывает география: однокоренные фамилии и прозвища встречаются в основном на Украине и в Белоруссии, которые исторически имели тесные связи с Прибалтикой. Самая правдоподобная версия — основа из латышского слова latakas, что значит «лоток, жёлоб; проток». Такое прозвище могли дать человеку, который рыл колодцы или прокладывал канавы, — ремесло, требовавшее сноровки и силы.

Менее вероятно, но тоже возможно, что прозвище связано с эстонским latikas — «лещ». В этом случае Латогузом называли рыбака, промышлявшего эту рыбу. В старину подобные прозвища легко вытесняли крестильные имена в быту и даже проникали в официальные бумаги. Прозвище Латогуз закрепилось за человеком как основное именование, а со временем оформилось в фамилию Латогузов. Потомок того, кого звали Латогузом, и стал носителем этой редкой и выразительной фамилии.