Фамилия Латотин — одна из тех, где на первый взгляд всё ясно, а при ближайшем рассмотрении начинаются вопросы. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Латотин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Латота. Но что такое «Латота»? В современном русском языке такого слова нет, и это сразу переводит разговор в область диалектов и исторической лексики.

Самая вероятная версия связывает основу с глаголом «латать» — чинить, ставить заплаты. В таком случае Латота — прозвище портного или сапожника, человека, который постоянно что-то штопает и подшивает. В северных и центральных говорах слово «латота» могло означать и просто бедняка, чья одежда вся в заплатках, то есть прозвище давалось по внешнему виду или роду занятий. Модель образования типична для русских фамилий: прозвище на -ота (как «работа», «зевота») плюс притяжательный суффикс -ин.

Менее распространённая, но лингвистически возможная версия — отчество от уменьшительной формы имени Латоний. Имя это редкое, греческого происхождения, но в святцах встречается. Однако для русской крестьянской среды оно маловероятно: фамилии с основой от канонических имён обычно выглядят как Латонин, а не Латотин. Переход «н» в «т» нехарактерен. Поэтому версия с прозвищем от «латать» остаётся основной.

Географически фамилия Латотин редкая, встречается в основном в центральных областях России и в Поволжье, что косвенно подтверждает её диалектное происхождение. В документах XVII–XVIII веков подобные прозвища фиксировались у посадских людей и крестьян. Таким образом, предки современных Латотиных с высокой долей вероятности были либо ремесленниками, умевшими латать одежду, обувь или утварь, либо людьми, получившими такое прозвище за небогатый, «заплатанный» вид.