Фамилия Левушкины в своей основе имеет имя Лев. Левушка — это просторечная, уменьшительная форма церковного имени Лев, которое, в свою очередь, является прямым переводом греческого Леон. Имя было распространено на Руси, так как в святцах значится сразу десять святых покровителей, в том числе преподобный Лев Катанский, епископ VIII века. Согласно преданию, он силой молитвы исцелял больных и однажды, чтобы посрамить языческого волхва, встал вместе с ним на костёр: волхв сгорел, а святой остался невредим.

По другой версии, фамилия могла образоваться от прозвища Левушка, которое давали левше (от прилагательного «левый»). Эта гипотеза менее правдоподобна, поскольку имя Лев встречалось в святцах часто, а прозвище по физическому недостатку было бы скорее единичным.

Фамилия закрепилась по типичной для русского языка модели: к основе Левушк- добавили суффикс принадлежности -ин. Это указывает на то, что предка звали Левушка — и его потомки стали Левушкиными. Форма с буквой «ё» (Лёвушкины) — вариант того же корня, возникший из-за разного произношения в говорах: в одних регионах имя Лев звучало мягче, отсюда и написание через «ё». Оба варианта имеют общее происхождение и не образуют самостоятельных фамильных родов.

Точное время и место возникновения фамилии определить сложно: процесс становления русских фамилий растянулся на несколько столетий, и массово они закреплялись в среде крестьянства лишь к XIX веку.