Фамилия Ликсаков — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В отличие от типичных «профессиональных» или «патронимических» фамилий на -ов, её основа не лежит на поверхности, и разобраться с ней можно только через диалекты и возможные искажения.

Первое, что бросается в глаза — суффикс -ак-. В русских фамилиях он часто указывает на прозвище, образованное от глагола или прилагательного: «гуляка», «работяга», «здоровяк». Соответственно, Ликсаков — это потомок человека по прозвищу Ликсак. Но что могло означать само слово «ликсак»? Прямого значения в современном литературном языке нет, поэтому приходится искать в говорах. Наиболее вероятная версия связывает корень с диалектным глаголом «ликсать» — в некоторых северных и сибирских говорах так говорили о человеке, который льстит, подлизывается, говорит сладко, но неискренне. «Ликса» или «ликсак» в таком случае — льстец, подхалим. Прозвище нелестное, но в крестьянской среде подобные характеристики давали метко и без злого умысла, просто как примету характера.

Менее вероятная, но допустимая версия — искажение при переписи. Фамилия могла возникнуть из более понятной формы, например, «Лысаков» (от «лысый») или «Ликсанов» (от редкого имени Ликсан). В условиях плохой грамотности и местного произношения буквы могли замениться, и «Лысаков» стал «Ликсаковым». Однако эта гипотеза слабее: суффикс -ак- в «Лысакове» нехарактерен (обычно «Лысов» или «Лысак»), а прямое «лысый» дало бы другую модель.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Уралу. Встречается в старых метрических книгах Симбирской, Казанской и Оренбургской губерний. Это косвенно подтверждает первую версию: именно в этих регионах бытовал глагол «ликсать» в значении «льстить». Сословно носители фамилии — почти поголовно государственные крестьяне и однодворцы, никакого дворянства или купечества в истории Ликсаковых не прослеживается. Фамилия осталась «народной», без громких представителей, но с чёткой бытовой подоплёкой: предок, скорее всего, был тем самым говорливым льстецом, за которым закрепилось прозвище Ликсак.