Фамилия Лильен — одна из тех, что пришли в русский язык из немецкой среды, но не через прямое заимствование, а через еврейскую традицию образования фамилий. В немецком написании она выглядит как Lilien и буквально переводится как «лилии». Это не просто красивое растение: в европейской геральдике и культуре лилия — символ чистоты и королевской власти, поэтому фамилия могла быть как «украшающей», так и указывать на дом с вывеской или гербом.

Обратите внимание на то, как образована фамилия. В немецком языке множественное число Lilien (лилии) часто использовалось в качестве фамилии без дополнительных суффиксов — это характерная модель для искусственных фамилий, которые массово присваивались еврейскому населению Австрийской и Российской империй в конце XVIII — начале XIX века. Власти требовали, чтобы у каждой семьи была немецкая фамилия, и многие выбирали «цветочные» варианты: Rosen (розы), Veilchen (фиалки), Lilien.

У фамилии Лильен есть и более редкая, русская версия происхождения — от женского имени Лилия, которое вошло в обиход в XIX веке. В таком случае фамилия образована по модели «имя матери + суффикс -ен» (как Аксён от Аксинья), но это менее вероятно: в русской традиции фамилии на -ен встречаются редко, а вот немецкое окончание -en для фамилий во множественном числе — норма.

Сравните с другими «немецко-еврейскими» фамилиями того же типа: Вейценбаум (пшеничное дерево), Зауэрштром (кислый поток), Левенфиш (рыба-лев), Цигенбаум (козье дерево), Квечман (тот, кто говорит неохотно). Все они составлены из двух немецких корней, и Lilien стоит в этом ряду особняком — это одно слово, без второго компонента. Это говорит о том, что фамилия могла быть дана не чиновником, а выбрана самим носителем как короткая и звучная.

Географически фамилия Лильен встречается в основном среди потомков еврейских общин, живших на территории современной Украины, Беларуси и Польши, где немецкий язык был языком делопроизводства в имперский период. В России и странах бывшего СССР фамилия редкая, часто записывалась на слух: Лильен, Лильян, реже Лилиен.