Фамилия Линючевы (в мужском роде — Линючев) строится по стандартной модели русских фамилий: к основе прозвища Линючий добавляется патронимический суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Линючего). Такое окончание характерно для фамилий, образованных от основ на мягкий согласный или шипящий.

В основе фамилии лежит прилагательное «линяющий». Прямое значение — «легко линяющий, непрочной окраски», а также «сбрасывающий, меняющий наружный покров, находящийся в состоянии линьки (о животных, птицах)». Прозвище Линючий могли дать по двум бытовым причинам. Первая: человек носил одежду из некачественной, быстро выцветающей ткани. Вторая: у него редели или выпадали волосы, что тоже воспринималось как «линька». Оба объяснения вполне жизненны для деревенского быта, где внешний вид и качество домотканого сукна имели значение.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным глаголом «линять» в значении «лениться, уклоняться от работы» — в некоторых говорах «линявый» означало вялый, медлительный человек. Однако в качестве основной версии стоит рассматривать именно внешний признак, так как прозвища по цвету, качеству одежды и физическим особенностям встречаются в русской ономастике чаще, чем прозвища по чертам характера.

Точное место возникновения фамилии Линючевы установить трудно. Процесс закрепления фамилий в разных слоях населения шёл с XV по XIX век, и прозвище Линючий могло возникнуть в любой из губерний центральной России или Поволжья. Одно можно сказать уверенно: фамилия редкая, не относится к числу «дворянских» по происхождению — скорее всего, её первые носители были крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию по уличному прозвищу при переписях.