Фамилия Липтушенко — типичный пример украинской модели образования фамилий. Суффикс -енко означает «маленький» или «сын», то есть Липтушенко — это буквально «сын Липтуха» или «потомок Липтуха». Такая модель была особенно распространена на Левобережной и Степной Украине в XVII–XVIII веках, и по ней образованы тысячи фамилий, от простых (Шевченко) до редких.

В основе фамилии лежит прозвище или неканоническое имя Липтух. Его происхождение спорно, и здесь есть две основные версии.

Первая и наиболее вероятная: Липтух — это народная, адаптированная форма греческого крестильного имени Ипатий (Ὑπάτιος), которое переводится как «высочайший», «консул». У русских существовала похожая просторечная форма этого имени — Липатий. В украинской среде звук «п» мог перейти в «пт», а окончание изменилось под влиянием местных говоров, дав форму Липтух.

Вторая версия связывает Липтуха с именем Олимпиан (от греческого «житель горы Олимп»). Это имя также могло сокращаться и адаптироваться в народной речи, но переход от «Олимп-» к «Липт-» менее прозрачен и требует дополнительных допущений, поэтому версия с Ипатием выглядит убедительнее.

Таким образом, человек по имени Липтух (в крещении, скорее всего, Ипатий) дал начало роду, потомки которого стали называться Липтушенко. Фамилия не указывает прямо на сословие или профессию предка, но говорит о том, что родоначальник был лично свободным человеком, носившим церковное имя в его просторечной форме — явление, типичное для казацкой и крестьянской среды Украины.