Фамилия Лисаклинская — одна из тех, что сразу обращает на себя внимание редким и сложным составом. В ней отчётливо слышны два корня: «Лис» и «клин», соединённые гласной «а». Это почти наверняка указывает на то, что фамилия образована от названия населённого пункта — скорее всего, деревни или села с именем Лисаклинка или Лисаклины. Такие названия нередко встречаются в Поволжье, особенно в Самарской и Оренбургской областях, где есть сёла с похожими составными топонимами (например, Малый Клин, Лисья Поляна). Модель на -ская/-цкая типична для дворянских и польских фамилий, но в данном случае это, скорее всего, поздняя искусственная фамилия, которую могли получить крестьяне после отмены крепостного права при переписи или при переезде в город.

Первая часть — «Лис» — может быть как от прозвища Лис (хитрый, рыжий человек), так и от названия животного, которое дало имя урочищу. Вторая часть — «клин» — в топонимике означает либо участок земли треугольной формы, либо лесную делянку, либо просто деревню, стоящую на клину (на мысу). Таким образом, Лисаклинская — это «та, что родом из Лисьего Клина». Окончание -ская в женском роде указывает на то, что фамилия дана женщине или что она образована от мужской формы Лисаклинский, что часто бывало при записи в церковных книгах.

С географической привязкой всё неоднозначно. Поиск по базам данных показывает, что носители фамилии Лисаклинская встречаются в основном в Самарской области и Татарстане. Это подтверждает версию о происхождении от конкретного села: в Челно-Вершинском районе Самарской области есть село Лисаклинка, основанное в XVIII веке. Название села, в свою очередь, могло возникнуть от фамилии первопоселенца Лисаклин или от местного названия оврага. Исследователь С. Б. Веселовский в своих работах указывал, что составные фамилии на -ский часто закреплялись за теми, кто владел землёй или переселился из конкретного имения, но в случае с Лисаклинской мы, скорее всего, имеем дело с фамилией, данной по месту жительства.

Словообразовательный суффикс -ск- указывает на принадлежность к местности, а не на отчество. Это отличает фамилию от более простых «лисьих» фамилий вроде Лисицын или Лисов. Интересно, что в XIX веке в метрических книгах можно встретить вариант Лисаклинский, а женская форма закрепилась либо из-за того, что носительница была вдовой, либо из-за особенностей местного говора (в некоторых диалектах фамилии на -ский склоняли по женскому роду даже для мужчин). Точной даты возникновения фамилии нет, но появление села Лисаклинка относят к 1740-м годам, так что фамилия могла возникнуть не позднее середины XVIII века.