Фамилия Лишентьев — редкая и неочевидная. На первый взгляд в ней слышится что-то от слова «лишать», но прямой связи с глаголом «лишить» здесь нет. Скорее всего, в основе лежит неканоническое имя или прозвище Лишень, Лишня или Лишаня. В древнерусской антропонимии корень «лиш-» мог означать «оставшийся сверх меры», «лишний», «избыточный». Так могли назвать позднего, нежданного ребёнка в семье, когда родители уже считали, что детей достаточно. Сравните с фамилиями Лишнев, Лишнов — они образованы от того же корня.

Суффикс «-ев» указывает на притяжательное значение: Лишентьев — буквально «сын Лишентия». Форма «Лишентий» — это не церковное имя, а народная, просторечная переделка исходного прозвища в подобие полного имени. В русских говорах нередко «облагораживали» прозвища, добавляя окончание -ий, чтобы звучало солиднее. Сравните: Копытий, Головинтий — такие формы фиксируются в переписных книгах XVII–XVIII веков.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России. Встречается в старых документах Вологодской, Костромской и Вятской губерний. Носители, скорее всего, происходили из крестьянской или посадской среды — в дворянских родословных книгах Лишентьевы не значатся. Поскольку фамилия редкая, её носители, вероятно, жили компактно в одном-двух уездах и не дали массового расселения.

В написании возможна путаница с фамилией Лишенцов (от «лишенец» — в советское время так называли лишённых избирательных прав). Но Лишентьев старше: его корни уходят в допетровскую эпоху, когда слово «лишенец» ещё не существовало. Если ваш предок — Лишентьев, он не из тех, кого «лишили», а из тех, кого в семье считали «лишним» в добром, бытовом смысле: поздним, неожиданным, но оттого не менее родным.