Фамилия Лискунова — женская форма от Лискунов, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Модель образования проста: основа Лискун плюс типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Лискунóва.

Корень фамилии — лыск- или лиськ-, который в русских говорах имел несколько значений. Самое вероятное: «лыска» или «лыскун» — прозвище человека с лысиной, плешью. В диалектах «лыска» — это лысина, а «лыскуном» могли называть лысого или бритого мужчину. Вторая версия, менее распространённая, от слова «лыскать» — блестеть, сверкать. Тогда Лискун — человек с блестящей, гладкой кожей или лысиной, что по сути близко к первому значению. Третья, более спорная, связь с глаголом «лыскать» в значении «увёртываться, хитрить» — прозвище для ловкого или изворотливого человека, но эта гипотеза слабее, так как в ономастике обычно приоритет отдают внешним признакам.

В написании фамилии есть особенность: корень «лыс-» перешёл в «лис-» под влиянием аканья или просторечного произношения. В старых документах можно встретить варианты Лыскунов, Лыскунова — они фиксируют исходную форму. Подобный переход типичен для фамилий, где «ы» в корне заменяется на «и»: Лисин вместо Лысин, Лихов вместо Лыхов. Если бы фамилия писалась через «ы», её бы однозначно выводили от «лысый», но акающий вариант не меняет сути.

Социальный контекст: фамилия Лискунов встречается в среде крестьян и мещан центральных и южнорусских губерний. Это не дворянская фамилия — прозвища по внешности чаще давали простым людям. В переписных книгах XVII–XVIII веков можно найти Лыскуновых в Тульской, Рязанской, Калужской областях. Географическая привязка подтверждает, что основа происходит от диалектного «лыска», а не от книжного или церковного слова.

Сравнение с однокоренными фамилиями: Лысков, Лысаков, Лысенко — все они восходят к той же теме облысения. Лискунова стоит в этом ряду, но с суффиксом -ун, который в русских прозвищах часто придавал значение деятеля или носителя признака: говорун, бегун, лыскун. То есть Лискунов — это буквально «тот, кто лыс», а не просто «сын лысого». Такая модель встречается реже, чем простые патронимы на -ов, и это делает фамилию более выразительной.