Фамилия Лисюткина образована от имени Лисютка — просторечной, народной формы крестильного имени Елисей. В переводе с древнегреческого Елисей означает «желанный», «чудесный», «красивый». В русской традиции полные церковные имена часто заменяли в быту уменьшительными или обиходными вариантами: так Елисей превращался в Лисютку через чередование начального гласного и добавление суффикса -ютк-, характерного для разговорной речи.

Принадлежность к роду передали через суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на отношение к конкретному человеку: чей? — Лисюткин, то есть «сын Лисютки» или «из семьи Лисютки». Форма Лисюткина — женский вариант, который в документах закреплялся за женщинами или детьми без указания пола в некоторых исторических записях.

Словообразовательная модель здесь необычна тем, что основа не животного происхождения (от «лиса»), а антропонимическая — от личного имени. Фамилии с суффиксом -ютк- в корне встречаются реже, чем с -ов/-ев, что делает Лисюткина ценной для ономастики: она сохраняет живую народную фонетику XIX — начала XX века, когда имя Елисей в деревнях звучало как Лисей, а затем Лисютка.

Искать географическое ядро фамилии стоит в центральных и северных губерниях России — именно там имя Елисей было особенно популярно среди крестьян и купечества. Встречаются однокоренные фамилии Лисюткин, Елисеев, Елисюткин, но именно вариант с начальным «Л» указывает на специфический диалектный переход, характерный для псковских и новгородских говоров.

Таким образом, носительница фамилии Лисюткина может считать своим предком человека по имени Лисютка — скорее всего, крестьянина или ремесленника, которого в обиходе звали не по церковному календарю, а по-домашнему, тепло и коротко. Фамилия не дворянская и не служилая, а народная, что типично для большинства русских родов, сложившихся после отмены крепостного права.