Основой фамилии Лисюткин послужило имя Лисютка. Лисютка – просторечный вариант христианского имени Елисей (в переводе с греческого – «желанный, чудесный, красивый»). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Лисютка, со временем получил фамилию Лисюткин.