Фамилия Ливенус — редкий случай, когда латинское окончание не маскирует германскую или славянскую основу, а указывает на вполне конкретное географическое происхождение. Это латинизированная форма, характерная для учёной среды и духовенства XVII–XIX веков. В основе лежит топоним Ливония (лат. Livonia) — историческое название территории современных Латвии и Эстонии, которую в Средневековье контролировал Ливонский орден. Фамилия буквально означает «ливонец», «выходец из Ливонии».

Такая модель образования — от названия земли с латинским суффиксом -us — типична для остзейского немецкого дворянства и пасторов, служивших в Прибалтике. В Российской империи эта фамилия встречалась в среде лютеранских священников и преподавателей Дерптского (Тартуского) университета. Латышский или эстонский вариант звучал бы иначе — с национальными суффиксами, поэтому Ливенус почти наверняка принадлежал к немецкоязычной общине.

Есть и другая, более прозаичная версия: фамилия могла возникнуть как «учёное» переоформление немецкой фамилии Ливен (Liven) или Ливент (Liwent) — по принципу, по которому, например, фамилия Мюллер превращалась в Мюллериус. В этом случае латинское окончание — искусственный приём, дававший владельцу намёк на образованность или принадлежность к клиру.

Судя по архивным данным, носители фамилии Ливенус в XIX веке фиксировались в Лифляндской и Курляндской губерниях, а также в Петербурге, куда перебирались прибалтийские немцы на государственную службу. Фамилия никогда не была массовой — это скорее штучный, семейный знак, за которым стоит конкретная история миграции из Ливонии в другие регионы империи.