Фамилия Логофети — редкий случай, когда в основе лежит не прозвище или имя, а прямая должность. Логофет (греч. λογοθέτης) — это чиновник в Византии и в средневековых православных государствах (в том числе в Молдавском княжестве и Валахии), ведавший канцелярией, государственной печатью, а иногда и финансами. По сути, это министр или канцлер. Фамилия, таким образом, образована от названия должности без какого-либо суффикса — это так называемая «архаичная» или «неоформленная» фамилия, где исходное слово стало родовым именем без добавления -ов, -ин или -ский.

Такая модель словообразования (прозвище → фамилия без изменений) характерна для украинской, белорусской и южнорусской традиции, а также для фамилий, пришедших из других языков. В русском контексте фамилия Логофети почти наверняка имеет не великорусское, а молдавское или греческое происхождение. В Молдавском княжестве логофеты составляли высшую боярскую аристократию, и фамилия могла закрепиться за потомками именно этих родов, переехавших в Российскую империю в XVIII–XIX веках.

С точки зрения ударения и окончания, фамилия не склоняется по русским правилам (как и многие фамилии на -и, -о, -у). Это дополнительно указывает на её иноязычные корни — в русском языке фамилии на -ети, как правило, не имеют патронимического суффикса и являются заимствованиями. Встречаются варианты написания с одной «ф» (Логофети) и с двумя (Логофетти), но первый вариант исторически точнее, так как восходит к греческому λογοθέτης, где одна «τ».

В дореволюционных справочниках фамилия фигурирует крайне редко — в основном в списках дворянства Бессарабской губернии и среди выпускников духовных академий. Это подтверждает версию о связи с церковной или боярской средой, где греческий язык и византийские титулы сохраняли вес. Носители фамилии Логофети — почти всегда потомки людей, чьи предки занимали высокие административные посты, а не просто получили прозвище по внешности или ремеслу.