Фамилия Ломаникова — женская форма фамилии Ломаников, а та, в свою очередь, образована от мужского прозвища Ломаник. В основе лежит глагол «ломать». Однако, в отличие от более распространённых фамилий вроде Ломов или Ломакин, суффикс -ик указывает на то, что прозвище могло относиться к человеку, который что-то ломал постоянно или профессионально. Ломаником могли называть не просто драчуна или буяна, а, например, рабочего на ломке камня, льда или металлолома, либо крестьянина, ломавшего коноплю (так называли процесс обработки стеблей для получения волокна). В говорах слово «ломать» имело и более узкие значения: «ломать шапку» — кланяться, «ломаться» — упрямиться, капризничать. Поэтому не исключено, что прозвище дали человеку с трудным, «ломаным» характером или, напротив, тому, кто любил кланяться и угождать.

С точки зрения словообразовательной модели фамилия Ломаников — типичная русская патронимическая фамилия, образованная с помощью суффикса -ов. Это указывает на то, что предок носителя фамилии был сыном человека по прозвищу Ломаник. Окончание -а в женском варианте Ломаникова — стандартный способ обозначения принадлежности к роду.

География фамилии, судя по открытым данным, тяготеет к центральным и южным регионам России, встречается в Воронежской, Ростовской и Волгоградской областях. Это косвенно подтверждает связь с земледельческим или промысловым прошлым, где ручной труд и обработка твёрдых материалов были обычным делом. В отличие от фамилии Ломакин, которая образована от той же основы, но с другим суффиксом (и часто связывается с диалектным «ломака» — забияка), Ломаников звучит более производственно-ремесленно, хотя точное значение прозвища могло зависеть от местных говоров и конкретной ситуации.