Фамилия Лошиков образована от прозвища или нецерковного имени Лошик. Основа здесь — слово «лох» в его старом, диалектном значении. В большинстве регионов России «лохом» называли неопытного, простоватого человека, но в псковских и тверских говорах это слово означало «рыба, чаще всего сёмга, зашедшая в реку на нерест», а в некоторых местах — «куст, заросли». Таким образом, прозвище Лошик мог получить либо человек нерасторопный и доверчивый, либо рыбак, либо тот, кто жил у заросшего берега.

Суффикс «-ик» в основе — уменьшительный, как в словах «носик» или «столик». Это значит, что Лошик — это не прямое указание на свойство, а скорее ласкательное или ироничное прозвище. А фамилия на «-ов» образована по патронимической модели: Лошиков — буквально «сын Лошика». Такая схема типична для русских фамилий XVI–XVII веков, когда прозвища отца становились наследственными для детей.

У фамилии есть однокоренные «собратья» — Лохов, Лошин, Лошкин. Но Лошиков отличается именно уменьшительным суффиксом: если Лохов мог означать «сын Лоха» напрямую, то Лошиков подразумевает, что прозвище было мягче, почти семейным. Встречается фамилия преимущественно в центральных областях России, особенно в бывших Рязанской и Тамбовской губерниях, где слово «лох» в значении «простофиля» было в ходу.

Версия, что фамилия связана с животным «лось», маловероятна: от «лось» образованы Лосев и Лосиков, а «Лошиков» звучит иначе. Ономаст Б. Унбегаун в своём словаре указывает, что основы с уменьшительными суффиксами часто указывают на прозвище, данное в детстве или по какой-то бытовой примете. Поэтому предок Лошиковых, скорее всего, был человеком с лёгким, может быть, чудаковатым нравом, за что и получил своё прозвище.