Фамилия Ложникова образована от прозвища Ложник. В основе этого прозвища лежит слово «ложка», но важно разобраться, кого именно так называли. Первое и самое очевидное значение — ремесленник, который вырезал деревянные ложки. Ложников, как и ложкарей, в русских деревнях было много, промысел был распространённым, особенно на севере и в Поволжье. Но есть и другая версия: ложки на Руси использовали не только для еды, но и как ударный музыкальный инструмент, наподобие кастаньет. Игра на ложках требовала сноровки, и того, кто владел этим искусством, тоже могли прозвать Ложником.

Менее вероятная, но возможная трактовка связывает прозвище с диалектным словом «ложка» — небольшой залив, лука или изгиб реки. В этом случае Ложником могли назвать человека, жившего у такого изгиба. Однако большинство ономастов склоняются к «ремесленной» или «музыкальной» версии: суффикс -ник в прозвищах часто указывал на род занятий.

Фамилия Ложникова — женская форма от Ложников. Мужской вариант образован по стандартной русской модели: к основе Ложник добавили патронимический суффикс -ов, означающий «сын Ложника». Встречается фамилия в разных регионах, но чаще фиксируется в центральной России и Поволжье — там, где был развит ложкарный промысел. Однокоренные фамилии — Ложкарев, Ложечников — порой путают, но они образованы от параллельных форм того же прозвища.