Фамилия Лубедев — редкий случай, когда написание подсказывает версию происхождения, но не даёт однозначного ответа. С первого взгляда она похожа на искажённую форму известной фамилии Лебедев: замена «е» на «у» могла возникнуть из-за диалектного произношения или ошибки писаря. Однако у этой версии есть слабое место — фамилия Лебедев одна из самых частых в России, и её носители редко меняли корень. Если бы Лубедев был просто вариантом, мы бы встречали его повсеместно, а он остаётся локальным.

Более правдоподобно выглядит связь с прозвищем Лубедь, которое могло относиться к человеку, обрабатывающему луб — кору липы, идущую на мочало, лапти или кровлю. В говорах слово «луб» означало и кору, и грубую ткань, и даже неотёсанного человека. Суффикс -ев указывает на типичную русскую модель образования от прозвища: «чей?» — Лубедев, то есть сын или потомок Лубедя. Ономастический словарь Б. Унбегана фиксирует похожие фамилии от названий ремёсел, и здесь логика та же: предок мог быть лубодёром или лубянщиком.

Стоит учесть и географию. Фамилия встречается в документах по Вологодской и Архангельской губерниям — регионах, где луб использовали широко, а северные говоры допускали замену «е» на «у» в безударной позиции («лубёд» вместо «лебедь»). Это не прямое доказательство, но косвенное подтверждение ремесленной версии.

Третья, менее вероятная гипотеза — отчество от нецерковного имени Лубеда, которое могло быть прозвищем от «лубить» (любить, ласкать) в диалектной форме. Но эта версия не подкреплена источниками, и её стоит упомянуть лишь как возможную.

Таким образом, скорее всего, Лубедев — фамилия, образованная от названия занятия или прозвища, связанного с обработкой луба. Она не массовая, а значит, её носители, вероятно, происходят из одной локальной группы, где это ремесло было распространено.